Angelsaksische invasive … DNA
| 05 oktober 2022 19:44 |
Voor het artikel in NRC heb ik geen (gratis) account nodig, het is gewoon zonder meer toegankelijk.
Ten overvloede hier een link naar de studie die aan het artikel ten grondslag ligt en die gepubliceerd is in Nature, 21-9-2021.
Het is een belangrijke studie, waarmee toch weer een stap gezet lijkt in de bestudering van aDNA (ancient DNA).
Al vaker heb ik vraagtekens gezet bij studies die voornamelijk uitgingen van modern DNA en voel me nu daarin gesteund door de volgende opmerking in deze studie: “so present-day populations may be poor proxies for ancient groups of unknown genetic makeup”.
Maar ik moet meteen ook pas op de plaats maken, want ik krijg er maar moeilijk een vinger achter wat ze nu precies gedaan hebben. Het is dermate specialistisch dat ik het eigenlijk niet eens goed kan lezen en dat wordt nog versterkt door het jargon en de vele afkortingen waarvan ik al lezend de betekenis steeds weer kwijt ben.
Ik heb er vandaag enkele keren op aangelegd, maar ik kom er niet doorheen. Zelfs met het aanvullende (te downloaden) materiaal kom ik niet echt verder.
Het ontbreekt me dus aan de mogelijkheid om sterke en zwakke punten aan te wijzen en moet aannemen dat de conclusies geldig zijn.
Toch wil ik het volgende als probleempjes voorleggen, in de hoop dat iemand me er mee kan helpen.
In de eerste plaats vind ik de dataset waar het onderzochte aDNA vandaan komt
vreemd. Waarom is daar niet meer uit b.v. België en Noord-Frankrijk in meegenomen.
En Alt-Inden (tussen Aken en Keulen) lijkt helemaal niet te passen bij de rest van de dataset (zie fig. 1).
In dit verband zit ik hier mee:
Maar … als alleen met aDNA uit deze regio’s gewerkt wordt, dan vind je toch nooit een ‘potential source’ buiten deze regio’s in CNE (Continental Northern Europe)?
Of zie ik dit verkeerd?
En als ik het goed begrijp heeft men toch gebruik gemaakt van modern DNA, om daar het aDNA op te ‘projecteren’.
Groet,
Dagobert
Science: An orderly arrangement of what at the moment seem to be facts.
Ten overvloede hier een link naar de studie die aan het artikel ten grondslag ligt en die gepubliceerd is in Nature, 21-9-2021.
Het is een belangrijke studie, waarmee toch weer een stap gezet lijkt in de bestudering van aDNA (ancient DNA).
Al vaker heb ik vraagtekens gezet bij studies die voornamelijk uitgingen van modern DNA en voel me nu daarin gesteund door de volgende opmerking in deze studie: “so present-day populations may be poor proxies for ancient groups of unknown genetic makeup”.
Maar ik moet meteen ook pas op de plaats maken, want ik krijg er maar moeilijk een vinger achter wat ze nu precies gedaan hebben. Het is dermate specialistisch dat ik het eigenlijk niet eens goed kan lezen en dat wordt nog versterkt door het jargon en de vele afkortingen waarvan ik al lezend de betekenis steeds weer kwijt ben.
Ik heb er vandaag enkele keren op aangelegd, maar ik kom er niet doorheen. Zelfs met het aanvullende (te downloaden) materiaal kom ik niet echt verder.
Het ontbreekt me dus aan de mogelijkheid om sterke en zwakke punten aan te wijzen en moet aannemen dat de conclusies geldig zijn.
Toch wil ik het volgende als probleempjes voorleggen, in de hoop dat iemand me er mee kan helpen.
In de eerste plaats vind ik de dataset waar het onderzochte aDNA vandaan komt
vreemd. Waarom is daar niet meer uit b.v. België en Noord-Frankrijk in meegenomen.
En Alt-Inden (tussen Aken en Keulen) lijkt helemaal niet te passen bij de rest van de dataset (zie fig. 1).
In dit verband zit ik hier mee:
Quote
Our new continental medieval data from regions bordering the North Sea provide a unique opportunity to further investigate the potential source of the CNE-related ancestry increase that we have described above (Supplementary Note 3).
Maar … als alleen met aDNA uit deze regio’s gewerkt wordt, dan vind je toch nooit een ‘potential source’ buiten deze regio’s in CNE (Continental Northern Europe)?
Of zie ik dit verkeerd?
En als ik het goed begrijp heeft men toch gebruik gemaakt van modern DNA, om daar het aDNA op te ‘projecteren’.
Quote
We performed principal component analysis (PCA) on 5,365 present-day northwestern Europeans, from Ireland to Sweden, and projected our ancient genomes onto this genetic variation (Fig. 2).
Groet,
Dagobert
Sorry, alleen geregistreerde gebruikers mogen berichten plaatsen in dit forum.